Speciální nástroje jsou specializované nástroje vyrobené podle individuálních požadavků zákazníků. Používají se hlavně v situacích, kdy výrobní úkoly již nelze řešit standardními nástroji. To je například případ, kdy je úloha zpracování příliš složitá pro standardní nástroje nebo když je vyžadována nižší doba cyklu. V praxi je třeba použít několik nástrojů, které vedou k delším prostojům, většímu opotřebení a větší náchylnosti k chybám.
V tomto případě je alternativou speciální nástroj. Jedná se o nástroje, které jsou speciálně vytvořeny pro individuální potřeby. Může to být směs různých nástrojů, například pomocí těchto nástrojů můžete provádět několik operací bez zastavení. Existují však také speciální nástroje pro jednotlivé pracovní kroky, jejichž geometrie má speciální další funkce. Speciální nástroje vyrobené z různých materiálů, jako je slinutý karbid, mohou být také vyrobeny v plném rozsahu podle požadavků zákazníka.
Vzhledem k tomu, že jejich tvar je téměř nekonečný, speciální frézy se používají především pro složité frézování a vrtání a vysoké řezné rychlosti. Například běžnou aplikací je kroková vrtačka. Zde speciální nástroj šetří spoustu času, protože všechny kroky lze provést v jedné operaci a používají vysoce výkonné materiály s velmi dlouhou životností. Další oblastí použití je například vystružování a tvářecí nástroj, který umožňuje v jedné operaci vytvářet určité geometrie a tvary.